A emissão de CTe pode ser feita de forma retroativa, e para isso, durante a emissão você altera a data.
Quando estiver emitindo seu CTe, existe a opção de “Informações adicionais” e com isso, terá o botão para habilitar “Alterar data de emissão do CTe”.
Ao clicar para habilitar, o campo permite preencher a data até 7 dias atrás.